Cristian Ganea a debutat în Liga 1 în 2015, pentru formația FC Brașov, în tricoul căreia a strâns 16 meciuri. A fost transferat apoi la FC Viitorul Constanța, pentru care a jucat în sezoanele 2015/16, 2016/17, 2017/2018, reușind să câștige și titlul de campion cu formația constănțeană. A marcat golul victoriei constănțene din preliminariile Champions League, 1-0 cu Apoel Nicosia, la 26 iulie 2017.
Debutul în Liga 1:
20.02.2015: Petrolul Ploiești - FC Brașov 1-0